Bei Menschen mit SCOTD funktioniert dieses Enzym nicht ordnungsgemäß, was zu einer Ansammlung von toxischen Substanzen im Körper führt, insbesondere von Propionyl-CoA und Methylmalonyl-CoA. Diese Ansammlung kann zu einer Vielzahl von Symptomen führen, darunter metabolische Azidose, Muskelhypotonie, Entwicklungsverzögerung und neurologische Probleme.